Oltre a impostare gli Internal/external URL dalla Management Console si devono anche aggiungere dalla powerdhell:
Set-WebServicesVirtualDirectory “servername\ews (Default Web Site)” -InternalUrl https://nome.dominio.it/ews/Exchange.asmx
Set-ClientAccessServer -Identity servername -AutoDiscoverServiceInternalUri https://nome.dominio.it/Autodiscover/autodiscover.xml
servername=nome del server exchange
nome.dominio.it= url di accesso esterno (es: owa.azienda.com)
Il link sottostante riporta tutti i comandi powershell per controllare e sistemare gli URL via powershell.